Sbmlsqueezer Generación de ecuaciones cinéticas para redes bioquímicas
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generador bioquímico

Sbmlsqueezer Descripción

SBMLSqueezer genera ecuaciones cinéticas para redes bioquímicas según el contexto de cada reacción. Cuando se usa como un complemento para celdas, utiliza la información de la representación de SBGN de ​​todos los componentes de la red. En el modo independiente, SBMLSqueezer evalúa las anotaciones de Systems Biology Ontology (SBO) para extraer esta información. Las leyes de tasas que pueden ser producidas por SBMLSqueezer incluyen varios tipos de acción masiva generalizada; Cinética de enzima detallada y generalizada, diversos tipos de ecuaciones de colinas, sistemas S y H y modelos aditivos para la regulación del gen. Configuración definida por el usuario Especifique la ecuación para solicitar cualquier tipo de reacción y cómo garantizar la consistencia de la unidad del modelo. Las ecuaciones se pueden crear utilizando menús contextuales. Todos los parámetros recién creados están equipados con la unidad derivada y anotados con los términos SBO, si están disponibles y los nombres textuales significativos. MathML se inserta directamente en el archivo SBML. Se proporciona exportación de látex o texto de ecuaciones diferenciales ordinarias. ¡Dale a SBMLSqueeze un intento de evaluar completamente sus capacidades!

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