Seqgene Herramienta multiplataforma para la minería Datos de datos de secuencia de próxima generación
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Seqgene Clasificación y resumen

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Seqgene Descripción

SeqGene es una aplicación de código abierto que tiene el objetivo principal para los conjuntos de datos de secuenciación de próximos generales. Además, se supone que el programa se centra en el control de calidad posterior a la alineación, la identificación de SNP e INDEL y la anotación, la cuantificación de la expresión de ARN, la expresión específica de los alelos y el análisis de la asociación de genotección de expresión. SeqGene es especialmente adecuado para las aplicaciones RNA-SEQ y EXONOME-SEQ, con enfoque en la codificación de proteínas y las regiones reguladoras de un genoma. Para las solicitudes de RNA-SEQ, SEQGENE implementó un nuevo método de análisis de ruta basado en topología para identificar los rutas de enriquecimiento de CO-enriquecimiento SNP-Expression y SNP-Expression.

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