Shiat genera parcelas de variación sabia del sitio a lo largo de una alineación de secuencia
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Shiat Clasificación y resumen

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Shiat Descripción

El nombre Shiat significa heterogeneidad de Shannon en la herramienta de alineación. Shiat genera parcelas de variación sabia del sitio a lo largo de una alineación de secuencia (incluida la entropía de Shannon y las medidas de distancia de la hamaming). Esta aplicación proporciona una interfaz gráfica intuitiva para el cálculo simultáneo de tres medidas de variación del sitio en las alineaciones de ADN o ARN. El índice de información de Shannon, la distancia de la hamaming y (1-Frecuencia de consenso) se calculan y se muestran en una serie de parcelas gráficas. Se pueden importar y comparar múltiples alineaciones, y un panel de vista de datos permite una fácil copia y pegado en aplicaciones externas. Se implementan cuatro medidas: - Arquitectura de información de Shannon (por posición) - 1- (Frecuencia de consenso) (por posición) - 1- (Índice Heterozigosidad H) (por posición) - Distancia de la hamaming (sumada pares a través de la alineación)

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