Treensenatcher plus Una herramienta de captura de árboles filogenéticos
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Treensenatcher plus Clasificación y resumen

Treensenatcher plus Etiquetas

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Treensenatcher plus Descripción

Treesnatcher Plus fue desarrollado para ser una aplicación Java impulsada por la GUI que automatiza la generación de una representación legible por máquina de árboles filogenéticos multifuterculares contenidos en imágenes de píxeles. Utiliza métodos de procesamiento de imágenes para preparar la imagen y detectar la estructura del árbol. El usuario supervisa el proceso de reconocimiento semiautomático y hace correcciones a la imagen y a la topología donde sea necesario. Al final, el programa produce un código de árbol de Newick que representa la estructura del árbol opcionalmente, incluidas las longitudes de la rama. TreesNatcher Plus es una versión extendida y re-conceptualizada de TreesSnatcher. Está bien equipado apoyar la investigación sobre filogenías complejas y será útil si uno quiere combinar filogenías basadas en una colección de árboles ya publicados que no están disponibles electrónicamente. Además, TreesNatcher Plus también es adecuado para fines educativos, ya que permite al usuario construir sus propios árboles y modificar las topologías existentes. Las figuras de los árboles filogenéticos se utilizan ampliamente en las publicaciones para ilustrar el resultado de un análisis evolutivo. Sin embargo, ya que uno no puede extraer sin esfuerzo una representación legible por máquina, es decir, una expresión de Newick, de la filogenia de tales imágenes, aquellos no son adecuados para el reanálisis posterior o la fácil compilación de topologías de árboles. Por lo tanto, una representación legible por computadora de un árbol publicado ha construido completamente a mano o mediante el uso de aplicaciones especiales. Aquí, TreesNatcher Plus puede ser valioso. Identifica la topología de un árbol (por ejemplo, una cifra de una publicación) con la interacción del usuario. La aplicación cuenta con una sofisticada interfaz de usuario gráfica que se basa en la API de giro Java. La nueva versión, Treesnatcher Plus, se ha desarrollado desde cero y ofrece una interfaz de usuario gráfica estable, utiliza métodos mejorados para el procesamiento de imágenes y para el análisis de la topología del árbol. En particular, ya no es necesario preprocesar una imagen antes de alimentarlo en TreesNatcher Plus. La nueva aplicación ofrece todas las herramientas de preprocesamiento de imágenes necesarias.

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