neuroconstruo 3D Modelado de red neuronal biofísicamente detallada
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red neuronal red neurona Neurociencia Computacional

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Neuroconstrume es una aplicación confiable creada para simplificar el desarrollo de redes complejas de neuronas biológicamente realistas, es decir, modelos que incorporan morfologías dendríticas y conductas de membrana celulares realistas. Se implementa en Java y genera archivos de script para los simuladores de neuronas y génesis, con soporte para otras plataformas de simulación (incluidas PSICS, MOOSE y PYNN) en etapas avanzadas de desarrollo. Utiliza las últimas especificaciones de Neuroml, incluyendo Morphml, ChannelML y NetworkML. El desarrollo de este software fue posible con la financiación del Wellcome Trust, el Consejo de Investigación Médica y el Proyecto de sinapsis de la UE. Principales características: Neuroconstrunst puede importar archivos de morfología en formato Génesis, neuron, neurolucida, SWC y MORFML para inclusión en células individuales o modelos de red, o más células abstractas también se pueden construir manualmente. Creación de redes de neuronas basadas en la conductancia posicionadas en 3D Los patrones de conectividad complejos entre grupos celulares se pueden especificar para las redes Los scripts de simulación se pueden generar para Neuron, Genesis, Moose, Psics y Simulators basados ​​en Pynn (Nota: No todos los proyectos se pueden generar para cada simulador) Los mecanismos celulares biofísicos realistas (sinapsis / mecanismos de canal) se pueden importar de los archivos de script nativos (* .mod o * .g) o crear desde plantillas usando canalml Generación automática de código para registrar datos de simulación y visualización / análisis de datos en neuroconstrunst Se pueden ver y administrar carreras de simulación grabadas a través de la interfaz del navegador de simulación Se puede usar una interfaz de scripts basada en Python para controlar la generación y ejecución del modelo, lo que permite que se ejecuten múltiples simulaciones para la optimización del modelo de red

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