GA FUZZY CRUTINGING Una herramienta de agrupamiento para datos de microarrays
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GA FUZZY CRUTINGING Clasificación y resumen

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GA FUZZY CRUTINGING Descripción

La aplicación GA FUZZY CLUSTERING se desarrolló para ser un programa que utiliza una combinación de algoritmo genético y método C-Medios para agrupamiento de datos de micromatrices y datos de matriz de distancia. Formato de archivo de entrada :: - Este programa utiliza un archivo de texto simple como entrada. - Todos los artículos de datos deben estar separados por tabuladores. - No se permiten valores faltantes. Microarray: - La primera línea contiene nombres de todas las columnas. - Cada línea (comenzando con segundo) debe tener el nombre del gen (1 columna o más) y los valores de expresión para cada condición. Matriz de distancia: - La primera línea contiene el título (una sola palabra o una cadena en la 1ª posición) y nombres de elementos - Cada línea (comenzando con segundo) debe contener el nombre del elemento (igual, como en la columna correspondiente) y los valores de las distancias entre este elemento y los demás. - La matriz es simétrica. - Todos los valores están normalizados (no superiores a 1.0). - Nota: También se permite la matriz de similitud. Formato de archivo de salida: - Parámetros del algoritmo. - Distribución de genes en clústeres (si la membresía es> 1 / Nuberofclusters) - Matriz de membresía para todos los genes. - Coordenadas de centros de clusters (en las unidades de expresión génica)

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