Bio :: Seqio :: Fastq BIO :: SEQO :: FASTQ es un flujo de entrada / salida de secuencia Fastq.
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Bio :: Seqio :: Fastq Clasificación y resumen

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Módulo perl secuencia flujo de entrada / salida Secuencia Fastq FASTQ

Bio :: Seqio :: Fastq Descripción

BIO :: SEQO :: FASTQ es un flujo de entrada / salida de secuencia Fastq. Bio :: Seqio :: Fastq es un flujo de entrada / salida de secuencia Fastq.SynopsisDo no use este módulo directamente. Úselo a través de la biografía :: seqio class.Este objeto puede transformar BIO :: SEQ y BIO :: SEC :: SECOTHITHQUALDICIO Los objetos hacia y desde Fastq Flat File Database.Fastq es un formato de archivo utilizado frecuentemente en el Centro Sanger para agrupar un FASTA Secuencia y sus datos de calidad. Una entrada típica de FastAQ toma el de: @ hcdpq1d0501 gatttgggtttcaaagcagtatcgatcaaatagtaaatcatttgttcaactcacagttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttttTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTI + * '')) ** 55CCF >>>>>> CCCCCCC65 ..... Los archivos Fastq tienen datos de secuencia y calidad en una sola línea y los valores de calidad son codificados de un solo byte. Para recuperar los valores decimales para las cualidades, debe restar 33 (o octal 41) de cada byte y luego convertir a un entero de '2 dígitos + 1 espacio'. Puede comprobar si 33 es el número correcto porque el primer byte que siempre es '!' Corresponde a un valor de calidad de 0.Requirements: · Requisitos de Perl: · Perl

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