Paquete :: bioperl Un paquete para instalar módulos de CPAN externos utilizados por Bioperl 1.5.2
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Un paquete para instalar módulos de CPAN externos utilizados por Bioperl 1.5.2 BUNDLE :: BiOperl es un módulo Perl que no contiene funcionalidad o código real en absoluto. La distribución de Bioperl de http://bioperl.org contiene código y módulos que pueden usar o requieren módulos de PERL 'externos' adicionales para funcionalidad avanzada. Muchos de los módulos externos no están contenidos dentro de la distribución estándar de Perl. Estos módulos externos se pueden obtener de la Red integral de Archivo PERL (CPAN) ubicada en http: //www.cpan.org.note: La última versión de este paquete incluye todos los módulos de CPAN externos que se enumeran como dependencias del funcionario BIOPERL 1.5.2 Liberación de CODEBASE.Las únicas excepciones son los módulos DBD :: y DBI ::, que realmente son mejores instalados por sí solos, si tiene la necesidad de cargar y consultar relacional. Bases de datos. Estos módulos no se requieren: amplían enormemente la funcionalidad de Bioperl de varias maneras. Para obtener el mejor uso de Bioperl, particularmente después del lanzamiento de BIOPERL 1.0, recomendamos al menos tener el LWP :: Acceso a la red y el XML :: Módulos relacionados instalados.bundle :: bioperl es un módulo PERL que no contiene funcionalidad o código real en absoluto. Es esencialmente un módulo especial de PERL que significa ser utilizado por el módulo CPAN.PM para simplificar la tarea de instalar automáticamente múltiples módulos en un paso fácil. Los usuarios esencialmente pueden decirle a CPAN.PM a 'Instalar BUNDLE :: BIOPERL' y CPAN.PM Descargará, instalará y configurará todos los módulos que se enumeran en el módulo BOOPERL BANDLE. Consulte la sección de la sinopsis o DO PERLDOC CPAN Para conocer cómo usar el módulo CPAN.PM para instalar Bundles.Note: Este proceso se complica por el hecho de que algunos módulos externos de Bioperl tienen sus propias dependencias y requisitos previos. En particular, el módulo XML :: Parser requiere la instalación previa del paquete 'XPAT' que reside fuera de CPAN en paquete de instalación :: El proceso Bioperl puede repetirse varios veces para completar la instalación completa de todos los módulos listados. Algunos módulos externos son complicados o pueden tener dependencias. Nota: Este paquete no instala Bioperl :) Sólo los módulos adicionales que el código de Bioperl utiliza ocasionalmente. Aún necesitará obtener la distribución de BIOPERL de CPAN o http://bioperl.org e instalarlo de la manera habitual: PERL makefile.pl Hacer que la prueba haga que InstallcPan.pm tenga muchas funciones, incluida la capacidad de descargar pero no instalar el Módulos enumerados en el paquete Bioperl.SynopsisPerl One Liner usando cpan.pm: Perl -mcpan -e 'install bundle :: bioperl'use of cpan.pm en modo interactivo: $> perl -mcpan -e cpan shell> install bundle :: BIOPERL CPAN> Quitjust Al igual que la instalación manual de los módulos PERL, el usuario puede necesitar acceso de la raíz durante este proceso para asegurar el permiso de escritura dentro del directorio de Inttalation. Requisitos: · Perl

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