TripLec fue desarrollado para ser un programa para construir árboles de consenso a partir de triples arraigados. Uso java -jar triplec.jar noreps infile.newick Aquí Noreps es el número de reconstrucciones triples para usar para el consenso. Esto se requiere porque la reconstrucción es un algoritmo aleatorio. Para pequeños árboles de aproximadamente 20 taxones 1000 réplicas es suficiente. Pero los números más grandes deben usarse para conjuntos de datos más grandes. Infile.newick es un archivo de texto con un nuevo árbol por línea. Se considera que los árboles están enraizados y cada árbol debe contener solo las etiquetas de los taxones del primer árbol. Eso es árboles después de que el primero no debe contener nuevos taxones. Aunque no es un error tener árboles con menos taxones que el primer árbol como parte del consenso, este método no es un método de super-arbolado. El desempeño en estas condiciones no se ha probado y esperamos que se desempeñaría mal.
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