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Bio :: Índice :: Blast Clasificación y resumen
- Licencia:
- Perl Artistic License
- Nombre del editor:
- Jason Stajich
- Sitio web del editor:
- http://search.cpan.org/~birney/bioperl-1.4/Bio/PopGen/IO.pm
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Bio :: Índice :: Blast Descripción
BIO :: ÍNDICE :: BLAST es un módulo PERL con índices informes de explosiones y admite la recuperación según la (s) adhesión (s) de consulta (s). BIO :: Índice :: Blast es un módulo PERL con índices informes de explosiones y admite la recuperación según la (s) adhesión (s) de consulta (s) .synopsis. Use estricto; Use BIO :: Índice :: Blast; mi ($ indexfile, $ file1, $ file2); My $ index = NEW BIO :: ÍNDICE :: BLAST (-FILENAME => $ indexfile, -wlite_flag => 1); $ index-> make_index ($ file1, $ file2); My $ ID; mis datos $ = $ index-> get_stream ($ id); My $ bplite_report = $ index-> fetch_report ($ id); Imprimir "Query Is", $ bplite_report-> consulta, "n"; Mientras (mi $ sbjct = $ bplite_report-> nextsbjct) {imprimir $ sbjct-> nombre, "n"; Mientras (MIS $ HSP = $ SBJCT-> NEXTHSP) {Imprimir "T E-Value", $ Hsp-> P,} Imprimir "N"; } Este objeto permite que uno construya un índice en un archivo de explosión (o archivos) y proporcione un acceso rápido al informe de Blast para esa adhesión. Nota: para los mejores resultados 'Use estricto'. Requisitos: · Perl
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