Bio :: Índice :: Blast

BIO :: ÍNDICE :: BLAST es un módulo PERL con informes de explosiones de índices y admite la recuperación según la (s) adhesión (s) de consulta (s).
Descargar ahora

Bio :: Índice :: Blast Clasificación y resumen

Anuncio publicitario

  • Rating:
  • Licencia:
  • Perl Artistic License
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Jason Stajich
  • Sitio web del editor:
  • http://search.cpan.org/~birney/bioperl-1.4/Bio/PopGen/IO.pm

Bio :: Índice :: Blast Etiquetas


Bio :: Índice :: Blast Descripción

BIO :: ÍNDICE :: BLAST es un módulo PERL con índices informes de explosiones y admite la recuperación según la (s) adhesión (s) de consulta (s). BIO :: Índice :: Blast es un módulo PERL con índices informes de explosiones y admite la recuperación según la (s) adhesión (s) de consulta (s) .synopsis. Use estricto; Use BIO :: Índice :: Blast; mi ($ indexfile, $ file1, $ file2); My $ index = NEW BIO :: ÍNDICE :: BLAST (-FILENAME => $ indexfile, -wlite_flag => 1); $ index-> make_index ($ file1, $ file2); My $ ID; mis datos $ = $ index-> get_stream ($ id); My $ bplite_report = $ index-> fetch_report ($ id); Imprimir "Query Is", $ bplite_report-> consulta, "n"; Mientras (mi $ sbjct = $ bplite_report-> nextsbjct) {imprimir $ sbjct-> nombre, "n"; Mientras (MIS $ HSP = $ SBJCT-> NEXTHSP) {Imprimir "T E-Value", $ Hsp-> P,} Imprimir "N"; } Este objeto permite que uno construya un índice en un archivo de explosión (o archivos) y proporcione un acceso rápido al informe de Blast para esa adhesión. Nota: para los mejores resultados 'Use estricto'. Requisitos: · Perl


Bio :: Índice :: Blast Software relacionado

Dbix :: dbstag

DBIX :: DBSTAG es un módulo PERL para la base de datos relacional a la asignación jerárquica (STAG / XML). ...

145

Descargar