Biomaj BIOMAJ (Biologie Mises A Jour) es un motor de flujo de trabajo dedicado a la administración biológica del banco de datos.
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BIOMAJ (Biologie Mises a Jour) es un motor de flujo de trabajo dedicado a la administración biológica del banco de datos. BIOMAJ (Biologie Mises a Jour) es un motor de flujo de trabajo dedicado a la administración biológica del banco de datos. El software BIOMAJ automatiza el ciclo de actualización y la supervisión del repositorio de Banco de Datos a nivel local. El conocimientoBiológico en un contexto genómico o post-genómico se basa principalmente en el análisis de bioinformáticos transitivos que consiste en una comparación iterativa y periódica de los datos recién producidos contra el corpus de información conocida. En el proyecto a gran escala, este enfoque necesita software de bioinformáticos precisos, tuberías, interfaces y numerosos bancos biológicos heterogéneos, que se distribuyen en todo el mundo. Un proceso de integración que consiste en reflejar e indicar esos datos es obviamente un paso preliminar esencial que representa un gran desafío y un cuello de botella en la mayoría de los proyectos bioinformáticos; BIOMAJ tiene como objetivo resolver este problema, proponiendo un entorno flexible y robusto totalmente automatizado. Aquí hay algunas características clave de "BIOMAJ": sincronización: · Protocolo remoto múltiple (FTP, HTTP, RSYNC, copia local) · Manejo de excepciones potentes · Transferencias de datos Verificación de integridad · Versión de liberación usando un enfoque incremental · Transporte múltiple · Directorio de árbol de datos Normalización Post procesamiento: · Descripción avanzada del flujo de trabajo (DAG) con lenguaje de sintaxis normalizado · Indexación posterior al proceso para varios programas de bioinformática (Blast, SRS, FASTACMD, ReadSeq, etc ...); · Fácil integración de scripts personales para automatizaciones de post-procesamiento bancario SUPERVISIÓN: · Instalación de informes: Generación automática del informe web · Generación de gráficos de historia para un mejor análisis de repositorio bancario · Instalación de alerta para la supervisión del ciclo de actualización. · Consulta en línea de datos Contestuos de almacén

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