TRANSPOSONPSI TRANSPOSONPSI es una herramienta de análisis para identificar la homología de la secuencia de proteínas o de ácido nucleico.
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TRANSPOSONPSI es una herramienta de análisis para identificar la homología de la secuencia de proteínas o de ácido nucleico. TRANSPOSONPSI es una herramienta de análisis para identificar la homología de la secuencia de proteínas o de ácido nucleico a proteínas codificadas por diversas familias de elementos transposibles. PSI-BLAST se usa con una colección de perfiles de homología ORF (retro-) TRANSPOSON ORF para identificar alineaciones estadísticamente significativas. Este método se puede usar para identificar los posibles orfs de transposón dentro de un conjunto de proteínas, o para identificar las regiones de la homología del transposon dentro de una secuencia de genoma más grande. . Esto es particularmente útil para identificar homologías de transporte degeneradas dentro de las secuencias del genoma que escapan la identificación y el enmascaramiento mediante el uso de repetición de repetición y una biblioteca de nucleótidos asociados de elementos repetitivos. Se ha utilizado rutinariamente en el Instituto de Investigación Genómica para ayudarlo en el descubrimiento de elementos móviles a través de los elementos móviles Incluyendo protozoos, plantas, hongos y animales. Requisitos: · Blast NCBI, incluyendo Blastall y BlastPGP · Bioperl

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