Arbolado Análisis de datos genéticos facilitados.
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Arbolado Descripción

Los árboles evolutivos se usan con frecuencia para describir las relaciones genéticas entre las poblaciones. Los árboles jerárquicos, bifurcantes son un modelo razonable para la evolución de las secuencias y especies de ADN, pero pueden o no ser apropiadas para describir la estructura de la población en las poblaciones relacionadas con el flujo de genes. Por ejemplo, si las poblaciones están dispuestas en un patrón de escalones, las relaciones genéticas entre las poblaciones no seguirán un patrón jerárquico, y los árboles de unión vecino tradicional o los árboles de UPGMA pueden no ser herramientas apropiadas para describir la estructura de tales poblaciones. TreeFit es una aplicación simple desarrollada para ayudarlo a analizar qué tan bien se adapta a un árbol los datos genéticos desde el árbol. TreeFit crea árboles de unión vecino y de UPGMA desde una matriz de distancia genética, y luego compara la distancia genética observada entre las poblaciones con la distancia genética en el árbol. La similitud entre estas distancias es expresa como R-Squared, la estadística familiar utilizada para resumir la dispersión de puntos alrededor de una línea de regresión de mínimos cuadrados.

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