Tapa Análisis de trinquete de parsimonia hecho fácil.
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Tapa Descripción

PaUP es una aplicación práctica y fácil de usar especialmente diseñada para ayudarlo con análisis de ratchet de parsimonia y probabilidad. La PEP permite el cálculo del soporte de Bremer (BS, los valores de decaimiento; Bremer 1988) utilizando el algoritmo de ratchet de parsimonia (Nixon, 1999). Alternativamente, BS también se puede calcular sin usar el trinquete. Además, las búsquedas simples de trinquete de parsimony se pueden realizar con PAP, también superponiendo ciclos de adición aleatoria en el procedimiento de trinquete publicado (Nixon, 1999) para disminuir aún más el ligero riesgo de que incluso el trinquete se atasca en una sola serie de ciclos. Aquí, una serie de iteraciones de trinquete (comúnmente alrededor de 200 iteraciones) se inicia repetidamente desde diferentes árboles de partida, y se recolectan árboles más cortos de todas estas series de iteraciones.

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