De unión rápida QuickJoin implementa una heurística para acelerar unirse al vecino, hacer que el vecino se uniera a los grandes conjuntos de taxones.
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QuickJoin implementa una heurística para acelerar la unión al vecino, haciendo que el vecino se uniera a los grandes conjuntos de taxones. El proyecto QuickJoin implementa una heurística para acelerar unirse al vecino, hacer que el vecino se uniera a los grandes conjuntos de taxones. El árbol inferido es idéntico al árbol inferido por el método de unión del vecino tradicional, pero la heurística (potencialmente) construirá el árbol significativamente más rápido. Objetos: el programa QuickJoin, QJOIN lee una matriz de distancia en formato PHYLIP desde un archivo de entrada o STDIN, y salga del árbol inferido, en formato Newick, a un archivo o STDOUT. Ejecute 'QJOIN --Help' para obtener más información .instalación: desde SourceChe QuickJoin paquete está escrito en C ++. Debe compilar cualquier sistema similar a Unix. Para instalar el paquete, descargue el código fuente y desembale (tar XZF Quick-upt-abncar.gz, donde ABC es el número de versión de una inscripción rápida), luego ejecute configurar y realice en el subdirectory Quick-ABC creado. durante desempacar. Esto crea el programa QuickJoin, QJOIN, junto con una serie de programas de prueba. Para comprobar que todo salió correcto, corrí. Si todas las pruebas pasan, instale el programa QJOIN ejecutando Make Install. Lea el archivo de instalación para obtener más información. FROM BINARYCURTY, la única distribución binaria está en paquetes de RPM. Podrían aparecer otros formatos, si me piden que los construyan (y le dijeron cómo ...). Para instalar, descargue el archivo y ejecute rpm -u quick-upion-version.arch.rpm.Qué nuevo en esta versión: · Esta versión divide la salida, cuando realiza bootstrapping, en dos árboles, uno anotado con longitudes de rama y una anotada con los valores de bootstrap. · Esto facilita el post-procesamiento, ya que la mayoría de las herramientas admiten una sola anotación de sucursales pero no dos.

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