CLC Banco de trabajo principal Un entorno de software que permite a los usuarios hacer una gran cantidad de análisis de secuencia de proteínas avanzadas
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CLC Banco de trabajo principal Descripción

Un entorno de software que permite a los usuarios hacer una gran cantidad de análisis de secuencia de proteínas avanzadas. CLC Main Workbench Crea un entorno de software que permite a los usuarios realizar una gran cantidad de análisis de secuencia de proteínas avanzadas, combinadas con la gestión de datos sin problemas, y excelente visualización gráfica y opciones de salida. CLC El banco de trabajo principal está disponible en Linux, Mac OS X y plataformas de Windows. Aquí hay algunas características clave de "CLC Main Workbench": Proyecto y gestión de datos: · Integración total de la entrada de datos, la gestión de datos, los resultados del cálculo y la exportación de datos. · Registro de historia detallada · Todos los tipos de archivos se pueden guardar en proyectos locales y se lanzaron desde el programa · Importar y exportar datos en una gran cantidad de formatos de archivo · Opción de trabajar en varios espacios de trabajo activos a la vez, lo que permite el trabajo simultáneo en múltiples proyectos. · Importación de archivos de datos de rastreo y puntajes de calidad de máquinas de secuencias de ADN automatizadas mediante formato de cromatografía estándar, formatos ABI y formato PHD (Fred) Características de la bioinformática en la mesa de trabajo de proteínas: · Alpha-helices y sábanas beta mostradas como anotaciones en la secuencia. · Vista de la molécula 3D · Predicción de Helix transmembrame · Antigenicidad · Predicción de la estructura de proteínas secundarias. · Búsqueda de Dominios de PFAM · Predicción basada en la web de péptidos de señal y sus sitios de escisión (Signalp - la mejor herramienta disponible) · Análisis y gráficos de hidrofobicidad. · Análisis y gráficos de carga de proteínas. · Traducción inversa de proteína al gen (varias tablas de traducción) · Traducciones interactivas de ADN y ARN a proteínas (ambas secuencias y alineaciones individuales) · Detección de escisión proteolítica. · Informe de estadísticas de proteínas (una o más proteínas en cada informe) · Informe integral que incluye una gama de análisis de proteínas en un documento · Búsquedas integradas de Uniprot (SWISS-PROT / TREMBL) · Búsqueda de datos de secuencia basada en la web en las bases de datos UNIPROT y NCBI, así como Google Características de la bioinformática en el banco de trabajo genético: · Visualización flexible de moléculas circulares. · Editor para diseño de imprimación gráficamente avanzado y algoritíbicamente avanzado. · Montaje de datos de secuencia de ADN. · Clonación molecular · Anotación automática SNP de secuencias. · Búsqueda y descubrimiento de patrones de ADN. · Análisis de la región de complejidad local. · Traducción inversa de proteínas a genes, basada en tablas de traducción de una serie de especies · Análisis y gestión de enzimas de restricción avanzada. · Análisis basados ​​en la parcela de puntos. · Estadísticas de ADN de forma corta que incluyen una serie de características de una molécula dada · Búsqueda de datos de secuencia NCBI · Acceso a la información web de PubMed Otras características de bioinformática: · Editor de secuencia de ADN, ARN y proteínas que muestra las moléculas lineales y circulares · Editor de alineamiento de ADN, ARN y proteínas. · Logotipos interactivos a lo largo de las alineaciones de ADN, ARN y proteínas. · Procesamiento por lotes de análisis en múltiples secuencias en un paso de trabajo · Búsqueda de motivos · Discovery de patrones (patrones desconocidos) · Opción de alineación de re-alineación y fix. · Gráficos de logotipo de secuencia a lo largo de ADN, ARN y alineaciones de proteínas · Anotación manual de secuencias. · Búsquedas integradas de pubmed · Búsqueda de secuencias basadas en la web usando Blast · Análisis basados ​​en la parcela de puntos. · Análisis de región de complejidad local y parcelas de complejidad. · Gráficos de fracción de GAP · Análisis y gráficos de contenido G / C. Viendo e informes: · Vista rápida avanzada · Vista de gráficos avanzados · Vista de histograma avanzada · Vista avanzada de la parcela de puntos · Búsqueda de características en secuencias y alineaciones. Requisitos: · RAM 256 MB requerido · 512 MB RAM recomendado · 1024 x 768 Visualización recomendada Limitaciones: · Demo completamente funcional de 4 semanas.

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