Explorador de microarrays Microarray Explorer (Maexplorer) es una instalación de minería de datos basada en Java para las bases de datos de microarrays de ADNc o Oligonucleiotiide.
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Microarray Explorer (Maexplorer) es una instalación de minería de datos basada en Java para las bases de datos de microarrays de ADNc o Oligonucleiotiide. Microarray Explorer (Maexplorer) es una instalación de minería de datos basada en Java para las bases de datos de microarrays de ADNc o Oligonucleiotiide. Su entorno de análisis de datos exploratorios proporciona herramientas para la extracción de datos de los perfiles de expresión cuantitativa a través de múltiples microarrays.Microarray Los datos se pueden ver e directamente manipulados en pseudoimágenes de matriz, parcelas de dispersión, histogramas, parcelas de perfil de expresión, análisis de clústeres (genes similares, k-medios o k-mediana, agrupación jerárquica, etc.), e informes. Una característica clave son los filtros de datos genéticos para restringir un conjunto de genes de trabajo a aquellos que pasan una variedad de pruebas y condiciones especificadas por el usuario. Los informes se pueden generar con acceso a la web de hipertexto a bases de datos genómicas, como Unigene, Genbank, Dbest, LocusLink, la imagen, la base de datos de microarrays de NCI / CIT MADB y otras bases de datos de Internet para conjuntos de genes que se encuentran en interés. Un enfoque principal de esta herramienta es Minería de datos interactivos con acceso a otras bases de datos genómicas web de soporte. El énfasis en la manipulación directa de los genes y los conjuntos de genes en gráficos y tablas proporciona un alto nivel de interacción con los datos que facilitan que los investigadores prueben ideas cuando busquen patrones. Aquí hay algunas características clave de "Microarray Explorer": · Analiza datos (después de que las matrices se han escaneado y se cuantifican puntos) · Maneja múltiples muestras de ADNc o oligo con manchas de replicación · Gestiona las muestras de replicación, llamadas Conjuntos de juegos de muestras y listas de conjuntos de condición · Gestiona con nombre de subconjuntos de genes. · Manijas de intensidad o relación (CY3 / CY5) Datos de matriz cuantificados · Analiza datos para 2 condiciones y perfiles de expresión de condición con N-condición, incluido ANOVA en cualquier número de condiciones de muestras de replicación · Conjuntos de genes de filtros de datos por estadísticas, agrupamiento, membresía del conjunto de genes · Proporciona manipulación directa de datos en gráficos, hojas de cálculo y gestión de muestras. · Accede a los servidores web genómicos de parcelas e informes. · Convierte sus datos utilizando el asistente de conversión de datos CVT2MAE · Tanto MaExplorer como CVT2MAE se escriben en Java para la portabilidad con los instaladores de descarga, lo que facilita la ejecución de cualquier sistema · Los usuarios pueden actualizar estos programas, una vez instalados, descargando solo los archivos JAR JAVA utilizando los comandos de actualización.

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