simbio Simbio es un paquete Java para crear modelos biológicos para el biólogo y otros.
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Aplicación Java Celda modelado modelo biológico Célula cardíaca Cardíaco

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Simbio es un paquete Java para crear modelos biológicos para biólogos y otros. Simbio es un paquete Java para crear modelos biológicos para biólogos y otros. Los modelos de células cardíacas están disponibles. SIIMBIO es un simulador para sistemas biológicos, como células cardíacas, células epiteliales y células β pancreáticas. Simbio está escrito en Java, utiliza XML y puede resolver ecuaciones diferenciales ordinarias. En el campo de la biología médica, se han acumulado extensos resultados de investigación con respecto a las funciones de nivel molecular y celular, pero los mecanismos de estas funciones complejas de células no se pueden explicar cuantitativamente. Debido a este hecho, un modelo dinámico cuantitativo que puede integrar datos experimentales y reproducir mecanismos biológicos en las computadoras es importante. Desarrollamos Simbio para tener una herramienta para una fácil creación de modelos celulares que emplean principios orientados a objetos. En Simbio, los modelos matemáticos, como un modelo de miocito que se describen utilizando ecuaciones diferenciales ordinarias se dividen en elementos de función, como los canales de iones y las variables, como las concentraciones de iones. En esta nueva forma de desarrollar modelos celulares, los elementos de función son igualmente independientes, y se pueden agrupar de acuerdo con las clasificaciones biológicas. Además, las correlaciones de las variables y elementos de función se pueden describir como un gráfico. El objetivo es una herramienta con la que varias funciones y mecanismos celulares basados ​​en los resultados experimentales se pueden combinar fácilmente a una estructura celular más compleja o incluso una célula completa que es adecuada para explorar nuevas hipótesis.simbio es una herramienta para hacer que sea más fácil construir. Modelos de organismo celular, y para promover el intercambio / reutilización de modelos. Proporciona las características necesarias para crear modelos que utilizan ecuaciones diferenciales ordinarias y modelos matemáticos, realizan cálculos integrales, gráficos de resultados de pantalla, extraer resultados a los archivos, cambiar parámetros y hacer cálculos. La estructura de SIMBIO se divide en 3 elementos principales. La primera describe los cálculos de modelos matemáticos con Java. El segundo describe los valores iniciales de los parámetros y la estructura de los modelos matemáticos con archivos XML. El tercero resuelve problemas de valor inicial de las ecuaciones diferenciales ordinarias con un motor de integración. Requisitos: · JDK 1.4 o posterior · LOG4J · Versión Xalan 2.7.0

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